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悪性症候群が起こる原因は明らかになっていません。しかし、抗精神病薬、パーキンソン病治療薬などの薬剤が発症に関与し、抗精神病薬の急激な増量や頻回な注射薬の使用がリスクと考えられていることなどから、中枢神経系のドパミン受容体の急激な遮断や調節障害が関与していると考えられています。
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