糞線虫症の診断は、糞便や血液を用いた検査をもとにして行います。糞便中に排泄されている成虫を顕微鏡的に確認します。便を培地におくと、糞線虫が蛇行して移動している様子がみえて、診断できることもあります。抗体を検索するための血液検査なども行うことがあります。
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