腸チフスは、患者や保菌者の便や尿に汚染された食べ物や飲み物、手指を介してチフス菌が口から体内に入り、感染することによって引き起こされます。腸チフスが流行している国への渡航で感染することが多いものの、輸入された長期保存食品(冷凍食品など)がチフス菌に汚染されていた場合なども感染源となり得ます。
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