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遅発月経だけが認められるものの、他の二次性徴が正常に訪れて2回目以降の月経も正常ならば、病気とは考えないのが一般的です。
思春期遅発症の症状のひとつとして生じた遅発月経では、ターナー症候群、脳腫瘍、栄養失調、甲状腺機能異常、神経性無食欲症、遺伝子異常によるホルモン分泌異常などが原因として考えられます。ほかにも幼児期の抗癌剤や放射線による治療、子宮奇形などが関係している場合もあります。
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