細菌性結膜炎の原因になりうる細菌としては、インフルエンザ菌や肺炎球菌、黄色ブドウ球菌、クラミジア、淋菌などが挙げられます。細菌性結膜炎は、病原体が目に直接接触することを介して感染が成立します。
クラミジアや淋菌は性感染症の原因としても知られる病原体であり、成人の場合は性交渉を介して感染が拡大します。
また、母親が感染している場合には細菌が付着した産道を介して赤ちゃんに結膜炎が引き起こされることもあります。
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