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ファンコニ貧血では、血小板や赤血球の輸血、血球増殖因子(G-CSF)の投与、感染症罹患(りかん)時の抗生物質・抗ウイルス薬・抗真菌薬の投与などが行われます。
血球減少に伴う症状が強い場合や支持療法では対処できない場合、骨髄異形成症候群や白血病を発症した場合には、骨髄移植が行われます。固形がんを発症した場合には、手術による摘出が治療の基本になります。
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