精巣は本来、胎児期にお腹の中で発生し、その後鼠径管を通過して陰嚢内まで下降するのが正常な発達過程です。しかし、胎生期の発達異常によってこの下降過程が途中で妨げられると、停留精巣が発生します。現在のところ、停留精巣の発症メカニズムは解明されていませんが、早産児や低出生体重児において発症リスクが高いことが知られています。また、男性ホルモンであるテストステロンの分泌異常も、重要な発症要因の1つとして指摘されています。
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