ランドウ・クレフナー症候群の原因は、現在のところ医学的に明らかになってはいません(2018年時点)。脳波上のてんかん性発作波との関係が推定されてはいますが、ステロイド治療により改善する場合があることから免疫学的機序も疑われているほか、遺伝子異常の報告もあります。しかし、いずれも確立されている説ではありません。
また、患者さんご本人や親御さんの生活習慣、妊娠時の行動などが発症のきっかけになることはありません。
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