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MERSに対しての根本的な治療法やワクチンは、現在(2017年)のところ存在していません。症状に応じた対症療法や基本的な感染予防策が中心となります。
呼吸器症状が増悪することがあるため、酸素投与や場合により人工呼吸器管理が必要になることもあります。日本呼吸器学会のガイドラインには、肺炎を契機に全身性炎症反応症候群に伴う急性肺障害を発症する患者さんに好中球エラスターゼ選択的阻害薬が使用可能であることが記載されています。また、腎不全に対しては透析、敗血症に対しては抗生物質などの投与が行われます。
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